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RNA甲基化润色——m6A/5mC RNA甲基化定量检测试剂盒

宣布者:艾美捷科技    宣布时候:2021-06-17     
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在(zai)原(yuan)生生物(wu)界(jie)(jie)、动(dong)物(wu)界(jie)(jie)和动(dong)物(wu)界(jie)(jie)中, 遗传物(wu)资 DNA和RNA上存在(zai)着(zhe)普遍的(de)(de)核酸(suan)(suan)化学润色。这一 特征(zheng)明显(xian)拓宽了基(ji)(ji)因组的(de)(de)多(duo)样(yang)(yang)性(xing), 是调控核酸(suan)(suan)从(cong)转(zhuan) 录到转(zhuan)录后抒发(fa)的(de)(de)首要手腕。但是, 与含有(you)20种 差别氨(an)基(ji)(ji)酸(suan)(suan)残(can)基(ji)(ji)的(de)(de)卵白质(zhi)比拟, RNA凡是只要4种碱 基(ji)(ji)(A、U、G、C)。为了完成其布局和功效的(de)(de)多(duo)样(yang)(yang)性(xing), RNA甲(jia)基(ji)(ji)化润色作为转(zhuan)录后程度的(de)(de)首要调控体例, 在(zai)很(hen)多(duo)生物(wu)学进程中必不可(ke)少。

 

研(yan)讨标明, mRNA(messenger RNA)、tRNA(transfer RNA)、rRNA(ribosomal RNA)、长链非(fei)编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和非(fei)编码小RNA包含(han) miRNA(microRNA)、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)]等各(ge)类RNA上均存在着(zhe)各(ge)类差别的(de)化(hua)(hua)学(xue)润色。这(zhei)些转录后的(de)润色别离(li)由甲基(ji)转移酶(mei)(Writers)和去(qu)甲基(ji)转移酶(mei)(Erasers)在特定位点上经(jing)由过程(cheng)酶(mei)促反映来(lai)装置或(huo)移除, 而甲基(ji)化(hua)(hua)连(lian)系卵白(Readers)能够(gou)或(huo)许(xu)读取(qu)润色信息并为下流功效的(de)执 行(xing)通报旌旗灯号。差别的(de)化(hua)(hua)学(xue)润色是(shi)经(jing)由过程(cheng)对(dui)应(ying)的(de)酶(mei)停止催(cui)化(hua)(hua)构成(cheng)的(de), 这(zhei)些酶(mei)具备脱氨(an)基(ji)(deamination)、甲基(ji)化(hua)(hua)(methylation)、糖(tang)基(ji)化(hua)(hua)(glycosylation)、硫醇化(hua)(hua)(thiolation)、转糖(tang)基(ji)化(hua)(hua)(transglcosylation)和异构化(hua)(hua)(isomerization)等多(duo)种功效。

 

化(hua)学(xue)润(run)(run)色(se)的(de)多样(yang)性, 和(he)差(cha)别(bie)位(wei)(wei)点上的(de)润(run)(run)色(se)可(ke)(ke)影响RNA可(ke)(ke)变剪(jian)接、运输、 折叠、稳定性等(deng)差(cha)别(bie)层(ceng)面的(de)功(gong)效。RNA润(run)(run)色(se)可(ke)(ke)间接影响RNA的(de)化(hua)学(xue)性子, 包含所带(dai)电荷、碱基配对、二级布局(ju)和(he)卵白质-RNA彼此感化(hua)等(deng), 这些(xie)变更又经(jing)由过(guo)程节制 RNA加工、定位(wei)(wei)、翻译和(he)终(zhong)究的(de)衰(shuai)变来调控基因(yin)抒(shu)发(fa)。此中(zhong)以m6A(N6- methyladenosine)、m1 A(N1 -methyladenosine)、5mC(5- methylcytosine)的(de)RNA甲(jia)基化(hua)润(run)(run)色(se)最为罕见。

 

RNA甲基化润色的催化机制.jpg

1 RNA的m6A润色

m6A便是(shi)在腺苷6位的(de)N原子上拔(ba)出一个甲基代替基,RNA转录本上的(de)各类化(hua)学润(run)色中m6A含(han)量最为(wei)丰硕, m6A润(run)色的(de)首(shou)要(yao)功效是(shi)影(ying)响RNA的(de)翻(fan)译和稳定性。m6A甲基化(hua)润(run)色首(shou)要(yao)由(you)相干的(de)催(cui)化(hua)酶催(cui)化(hua)构成, METTL3(methyltransferase-like 3)和METTL14(methyltransferase-like 14)连系构成的(de)异二聚体METTL3/METTL14是(shi)典(dian)范的(de)m6A甲基转移(yi)酶复合物, 担任大部分哺乳动(dong)物细胞内 mRNA的(de) m6A甲基化(hua)润(run)色。细胞内m6A甲基化(hua)润(run)色程度(du)不是(shi)静(jing)态稳定的(de), 其遭到细胞表里身分调控时具备(bei)静(jing)态可逆(ni)性。细胞内m6A甲基化(hua)润(run)色首(shou)要(yao)经(jing)由(you)过程 RNA连系卵白阐(chan)扬生物学感化(hua)。

 

2 RNA的m1A润色

m1A是由甲(jia)基(ji)转移酶催化的(de)(de)别(bie)的(de)(de)一种首(shou)要的(de)(de)RNA转录(lu)后润色(se) , 它普(pu)遍存在(zai)于 tRNA、mRNA、rRNA和线粒体 DNA编码的(de)(de)转录(lu)本中。与(yu)m6A差别(bie), m1A润色(se)的(de)(de)腺(xian)(xian)苷(gan)酸在(zai)N1位(wei)点产生甲(jia)基(ji)化。该位(wei)点位(wei)于沃森–克里克双螺旋布局(ju)的(de)(de)碱(jian)基(ji)配对(dui)界面 , 从而阻断了腺(xian)(xian)嘌呤与(yu)胸腺(xian)(xian)嘧啶(ding)或(huo)(huo)尿(niao)苷(gan)的(de)(de)互(hu)补(bu)配对(dui), 并对(dui)部分RNA布局(ju)或(huo)(huo)卵白质(zhi)-RNA彼(bi)此感化构(gou)成影响。

 

3 RNA的5mC润色

RNA的(de)(de)5mC润色是指(zhi)RNA胞嘧啶的(de)(de)第5位C原子(zi)产生甲基化(hua), 该润色也是静(jing)态可逆的(de)(de), 首要以(yi)SAM 作(zuo)为甲基供(gong)体, 在甲基转移酶催化(hua)下构成。5mC润色普遍(bian)散布在rRNA、mRNA、tRNA、snRNA(small nuclear RNA)、miRNA、lncRNA和(he)加(jia)强子(zi)相干的(de)(de)RNA(enhancer RNA, eRNA)中。RNA 5mC特(te)同性(xing)甲基转移酶包(bao)含(han) NSUN家属卵白和(he)DNMT2(DNA methyltransferase 2), 其布局(ju)特(te)点是含(han)有激进(jin)的(de)(de)半(ban)胱氨(an)酸(suan)残基 , 能够或(huo)许以(yi)SAM为甲基供(gong)体, 催化(hua)甲基转移到(dao)响应的(de)(de)RNA胞嘧啶残基上。

 

今朝对甲基化RNA所用的(de)检测手艺(yi)包含高(gao)通量测序(xu)、比色法和液相色谱质谱联(lian)用(LC-MS)等。艾美捷科技作(zuo)为专业的(de)性命(ming)迷信范畴(chou)处理(li)计划供给(ji)商,为您保(bao)举(ju)Epigentek品牌的(de)滞(zhi)销特点产物,助你颁(ban)发多篇高(gao)分文章。


中文称号英文称号货号规格
M6A RNA甲基化定量检测试剂盒(比色法)EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(Colorimetric)P-900548reactions
96reactions
 M5C RNA甲基化定量检测试剂盒(荧光法)MethylFlash 5-mC RNA Methylation ELISA Easy Kit (Fluorometric)P-900948reactions
96reactions



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